MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG2

Total Repeats: 293

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016972	GCT	2	6	1641	1646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016972	TCC	2	6	1685	1690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016972	TAC	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016972	GCT	2	6	1786	1791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016972	TGC	2	6	1813	1818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016972	CGTC	2	8	1913	1920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016972	CGT	2	6	1953	1958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016972	TGG	2	6	2033	2038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016972	TGAT	2	8	2095	2102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016972	GCTCG	2	10	2133	2142	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_016972	CGAG	2	8	2202	2209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016972	CTGAG	2	10	2275	2284	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016972	CTG	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016972	CGG	2	6	2351	2356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016972	TGG	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016972	CAG	2	6	2415	2420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016972	CTCGG	2	10	2462	2471	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016972	GGCT	2	8	2472	2479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016972	CCTGG	2	10	2594	2603	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016972	TGCG	2	8	2740	2747	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016972	GGA	2	6	2764	2769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016972	ATG	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016972	CACGA	2	10	4814	4823	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016972	TG	3	6	4852	4857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016972	GGA	2	6	4870	4875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016972	CCT	2	6	4916	4921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016972	TCC	2	6	5111	5116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_016972	GTG	2	6	5169	5174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016972	GCC	2	6	5402	5407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016972	GCC	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016972	GGGTC	2	10	5463	5472	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016972	TC	4	8	5471	5478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016972	A	6	6	5508	5513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016972	ACC	2	6	5518	5523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016972	GCT	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016972	TCC	2	6	5644	5649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_016972	CG	3	6	5765	5770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016972	GAG	2	6	5771	5776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016972	TCCGC	2	10	6836	6845	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_016972	CCA	2	6	6870	6875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_016972	TGG	2	6	6899	6904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016972	CGA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016972	CTG	2	6	7014	7019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016972	TCC	2	6	7074	7079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016972	GCCGTC	2	12	7082	7093	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016972	GGC	2	6	7112	7117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016972	GCCGC	2	10	7148	7157	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_016972	GTC	2	6	7165	7170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016972	CAG	2	6	8225	8230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016972	GC	3	6	9316	9321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016972	ACG	2	6	9424	9429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016972	AGC	2	6	10462	10467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016972	GCC	2	6	10495	10500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016972	T	6	6	10525	10530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016972	AAGAC	2	10	10588	10597	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016972	GCT	2	6	10630	10635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016972	CGG	2	6	11415	11420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016972	CCG	2	6	11449	11454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_016972	TC	3	6	11465	11470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016972	CGAC	2	8	11474	11481	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016972	CGG	2	6	11488	11493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016972	GC	3	6	11511	11516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016972	G	6	6	11522	11527	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016972	GTT	2	6	12496	12501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016972	AGT	2	6	12564	12569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016972	CCT	2	6	14030	14035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_016972	GCT	2	6	14036	14041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016972	AGG	2	6	14069	14074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016972	TC	3	6	14136	14141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016972	ACA	2	6	14154	14159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016972	G	6	6	16338	16343	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016972	GGC	2	6	16358	16363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016972	GCGG	2	8	16373	16380	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016972	G	6	6	16414	16419	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016972	GTC	2	6	16471	16476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016972	GGGC	2	8	16514	16521	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016972	GC	4	8	16523	16530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016972	CTGC	2	8	16548	16555	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016972	GGC	2	6	16584	16589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016972	CGG	3	9	16593	16601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016972	GAAGG	2	10	16609	16618	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016972	AGC	2	6	16840	16845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016972	GCG	2	6	16850	16855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016972	CTGC	2	8	16863	16870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016972	CG	3	6	16975	16980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016972	CGGT	2	8	16998	17005	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016972	GCC	2	6	17025	17030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_016972	CAG	2	6	17534	17539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016972	GC	3	6	17581	17586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016972	CACGC	2	10	17591	17600	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_016972	GCCC	2	8	17626	17633	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_016972	CGG	2	6	17668	17673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016972	CGG	2	6	17682	17687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016972	CGGC	2	8	17747	17754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016972	CTC	2	6	18174	18179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_016972	CGG	2	6	19764	19769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016972	CGGG	2	8	19791	19798	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016972	TCG	2	6	19834	19839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016972	CGGG	2	8	19846	19853	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016972	CTC	2	6	19854	19859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_016972	CAG	2	6	19881	19886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016972	CGT	2	6	19979	19984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016972	CGT	2	6	20006	20011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016972	CGT	2	6	20021	20026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016972	CCA	2	6	20030	20035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_016972	TCGG	2	8	20041	20048	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016972	TGC	2	6	20086	20091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016972	CG	3	6	25358	25363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016972	ACG	2	6	25380	25385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016972	GAC	2	6	25391	25396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016972	GGC	2	6	25397	25402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016972	GAC	2	6	25430	25435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016972	GGC	2	6	25460	25465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016972	ACG	3	9	25467	25475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016972	TGG	2	6	25477	25482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016972	GAG	2	6	25493	25498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016972	GCCG	2	8	25505	25512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016972	ACGT	2	8	25533	25540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016972	GGC	2	6	25550	25555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016972	CGG	2	6	25597	25602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016972	GAA	2	6	25928	25933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016972	CGGG	2	8	25957	25964	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016972	CGGTGC	2	12	26758	26769	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016972	TCC	2	6	29176	29181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_016972	AACG	2	8	29223	29230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016972	GCA	2	6	32359	32364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016972	GTCCC	2	10	32414	32423	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_016972	CG	3	6	34212	34217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016972	GCCC	2	8	34221	34228	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_016972	GGGC	2	8	34237	34244	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016972	GCGG	2	8	34697	34704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016972	CGG	3	9	34735	34743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016972	GGT	2	6	39875	39880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016972	GAT	2	6	39884	39889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016972	AG	3	6	39892	39897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016972	CTG	2	6	39916	39921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016972	TCA	2	6	39967	39972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016972	AG	3	6	40003	40008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016972	GC	3	6	40014	40019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016972	CGG	2	6	40047	40052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016972	GGC	2	6	40125	40130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016972	CGG	2	6	40163	40168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016972	CGA	2	6	40169	40174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016972	CCG	2	6	40184	40189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_016972	GCGG	2	8	40231	40238	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016972	CGGC	2	8	40254	40261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016972	GC	3	6	40260	40265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016972	GTC	2	6	40278	40283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_016972	CCCCA	2	10	40328	40337	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
150	NC_016972	TGCGC	2	10	40349	40358	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_016972	CGG	2	6	40380	40385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_016972	ACG	2	6	40462	40467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_016972	CGCGG	2	10	40498	40507	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
154	NC_016972	ACGGCG	2	12	40550	40561	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_016972	CGG	2	6	40695	40700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_016972	CGG	2	6	41225	41230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_016972	CGC	2	6	41243	41248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_016972	GGTCGA	2	12	41258	41269	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_016972	CGGG	2	8	41304	41311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
160	NC_016972	CCGG	2	8	41344	41351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_016972	GGGA	2	8	43140	43147	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016972	TTG	2	6	44113	44118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_016972	CGG	2	6	44120	44125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_016972	GCGGT	2	10	46417	46426	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
165	NC_016972	CGGG	2	8	46427	46434	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
166	NC_016972	GTG	2	6	47690	47695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_016972	CATTG	2	10	47721	47730	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
168	NC_016972	TCA	2	6	47748	47753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_016972	GCAC	2	8	47820	47827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
170	NC_016972	CGGG	2	8	47856	47863	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
171	NC_016972	ACC	2	6	47870	47875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_016972	GAC	2	6	47876	47881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_016972	CTC	2	6	47885	47890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_016972	CCGG	2	8	47929	47936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
175	NC_016972	CAC	2	6	47938	47943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
176	NC_016972	GCA	2	6	47950	47955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_016972	GCT	2	6	47956	47961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_016972	C	6	6	47971	47976	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
179	NC_016972	CGG	2	6	47980	47985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_016972	CGG	2	6	48017	48022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_016972	CCGG	2	8	48044	48051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
182	NC_016972	C	6	6	48077	48082	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
183	NC_016972	CCG	2	6	48088	48093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
184	NC_016972	GCCC	2	8	48170	48177	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
185	NC_016972	TCG	2	6	48218	48223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_016972	CCGG	2	8	48250	48257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
187	NC_016972	TCCCT	2	10	48485	48494	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
188	NC_016972	CTG	2	6	48504	48509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_016972	CGC	2	6	48526	48531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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191	NC_016972	CG	4	8	48883	48890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
192	NC_016972	GGT	2	6	48956	48961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
193	NC_016972	GGGAG	2	10	50092	50101	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
194	NC_016972	CGG	2	6	50106	50111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_016972	GCC	2	6	50136	50141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
196	NC_016972	GTG	2	6	50142	50147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
197	NC_016972	GAC	2	6	51398	51403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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203	NC_016972	CCTC	2	8	53912	53919	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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242	NC_016972	GCT	2	6	62114	62119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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271	NC_016972	TTC	2	6	70048	70053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_016972	CA	3	6	71834	71839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
288	NC_016972	CAGG	2	8	73139	73146	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
289	NC_016972	GCG	2	6	73187	73192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_016972	AG	3	6	73217	73222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
291	NC_016972	GC	3	6	73244	73249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
292	NC_016972	TGC	2	6	73254	73259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_016972	CCA	2	6	73270	73275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.